Ubiquiti ECS-Aggregation wyposażony jest w firewall stanowy, DPI (inspekcja pakietów), oraz IPS (system prewencji włamań), co pozwala na skuteczną ochronę przed atakami. Dodatkowo, urządzenie obsługuje ACLs oparte na MAC (Listy Kontroli Dostępu) oraz izolację urządzeń, co zwiększa bezpieczeństwo sieci, zapobiegając nieautoryzowanemu dostępowi.